
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物工程 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研发结论
实验考生研究近年来保鲜日子提升鸡肉片的对抗强度、持来说水力、亮光感、悬浮铁份量、ROS、脂质过腐蚀物、MDA、GSH和GPX4品质来分析健身肌肉组织安排血细胞系的铁意外死亡状态下。結果展现,保鲜日子提升后,鸡肉片的对抗强度在第四天和第6天为可观增涨;持水效果消减;背景色变深,耗尽亮光,鲜黑色变的暗黑色。与此同时,悬浮铁、几丁质酶氧和MDA的份量为可观增添,血细胞系凋亡率为可观提升。 研究了解人群添加其他冷冻箱阶段的背部腹肌备样的核核蛋白质含量,但是参与SDS-PAGE了解,核核蛋白质含量条带在其他阶段分布图平滑且相同(图1a)。结合核核蛋白质含量在其他备样中的理解现象,了解出现 同样一条组备样的中六位数更加接近于同样一条质量(图1b),说背部腹肌备样核核蛋白质含量兼备优秀的组内相同性和组间差别的性。 核营养素组学共鉴别结论出1996种核营养素。以B0为比较组,挑选B1、B2、B4和B6中的核核血清质实现距离性表明具体方法讲解,共鉴别结论到37七个DEPs。将火山图可视化数据,并依据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05几个标准的讲解DEP。然而现示如1c-f随时,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别鉴别结论出22、33、73和140个DEPs,里面分发型别调涨6、11、32和815个,调整16、22、41和54个。聚类分析法具体方法评定了不相同保鲜时候相关肌肉进行进行中核营养素的表明具体方法,然而现示现示相关肌肉进行核核血清质表明具体方法距离性近年来处理时间段的提升而提升(图1g)。
图1| 区别冷藏库时候的手臂肌肉样板核高蛋白组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 差别的要在冷藏室保存准确时间的背部肌肉样品英文差别的球蛋白解析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死掉核蛋白肽的PRM参考值定性分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 鉴于KEGG聚集差别的表达出来蛋清的铁去世工作机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱微生物提供了TMT按量蛋白质质含量质组学方法功能保障,拜谱菌物已研发团队已完成并实现了进一步优化完善的转录组学、蛋白质质含量组学、细胞代谢组学并且 多个学连合产品设备方法功能保障管理体制,欢迎致电咨询!
参照论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.