在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

论述报告单

1、从光敏的培养体细胞中获取DNA热塑蛋白酶质

想要分开光化学交连核脂肪酸-DNA结合物广泛使用于LC-MS解析，做者的开发半个种转化纯化解决方案，可从DNA中去必须化学交连核脂肪酸，仅在照晒时顺利按照可以人类基因组接受生物富集DNA化学交连核脂肪酸。用TRIZOL截取固色质并除去被抓获的非化学交连核核核球核苷酸，之后将其重消融以实行RNase消化不好吸收。顺利按照高周波截取视频得到核脂肪酸化学交连DNA的截取物，在硫氰酸胍中蒸煮转化，并在二氧化反应硅抽滤柱上较大洗滌以去必须化学交连核脂肪酸直达到。顺利按照核酸酶处置从DNA中挥发释放光化学交连核核核球核苷酸，并实行胰核核核球核苷酸酶消化不好吸收广泛使用于LC-MS解析。该方式方法起名为核脂肪酸化学交连DNA截取或XDNAX。

图1.核营养物质交连DNA分离出来或XDNAX步奏图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可可以排斥DNA的球胆固醇图谱

将光交连措施APP于MCF7体神经细胞，找到了1,805种待选淀粉酶质，这当中1,191种长期存在于3个或非常多次按顺序中。60%的DNA彼此功用组可能含有核酸组合的GO标注，在贫乏核酸组合标注的淀粉酶质质中，较大 的突出贡献来于核纤层淀粉酶质，此外是参与的印染质聚集和体神经细胞裂开的淀粉酶质质（图2）。

图2 . 可之间接触的面积 DNA 的血清质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3总结怎么写了DNA间接用组所抽象性的球核淀粉酶质酶质-DNA菜单栏简答主要涉及的核苷酸热塑肽。这涉及原因（1）球状DNA相通过组成域、（2）DNA 相通过无章区（IDR）和（3）原因与一些球核淀粉酶质酶质（随后组球核淀粉酶质酶相通过球核淀粉酶质酶）、RNA（随后剪接细胞）或相剥离 区室（随后核仁球核淀粉酶质酶）间接用而诱发的环境介于。

图3 . 可简单遇到 DNA的格局域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、酶联免疫法神经元扰动其间与DNA切合的转录细胞因子

雌性生长孕激素肾上腺素受体α（ESR1）驻落在胞质溶胶中，到最近遭到其配体，触及易位到神经元核，在那它与基因组组中的某个地区综合以激活开通某个的转录子程序。将血清饥饿的MCF7神经元裸漏于高药量雌性生长孕激素（10 nM 17β-雌二醇）44多分钟，与模以处理的对应神经元较为它们的的DNA双方的功效组（图4A）。另外，雌性生长孕激素激励后DNA双方的功效组中的ESR1加入了30倍（图4B）。总的我认为，在1,814个一定量的蛋清质-DNA双方的功效中，约有9%凸显出突破2倍的同质性的变化，并观查到与ESR1具备着双方的功效的蛋清如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 生长激素药治理乳房增生癌神经细胞 DNA 互相帮助组的按量十分（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

个人心得体会

调查进人人类什么是基因组的蛋清质以了解一下它是是怎样的被收录并付诸实践内容的，时不时是科学师一款不断的执着。人类什么是基因组可及性首要以DNA为机构的度角通过调查，然后，到近几年说不定，印染质凝胶的效果中的哪个蛋清质与DNA 会发生物理性相护效果尚不很清楚。应用零路程光化学交联，可表明DNA相护效果组中的大部份数蛋清质，XDNAX技术应用将看做蛋清质-DNA相护效果调查的厉害交通工具。

拜谱总结ppt

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的球氨基酸组学、装饰组学、排泄组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

参考使用专著：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.