
近日,常州医科师范大学独一加盟医院专家王学浩工程院院士的团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向治疗能力产生检测分析服务。
英语翻译子标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文翻译问题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
朋友部门:南京医科大学
学习材料:细胞
拜谱出具的服务:转录组测序+蛋白酶互作组+靶向治疗人体脂肪基础代谢组
技术设备路线图:
探析数据
01、YBX1被签定为HCC中糖酵解的关键因素人类基因
本研究分享数据资料显示采集HCC肿癌子样本(n=7)的单体安排性RNA测序数据资料显示集展开分享,发掘糖酵解灵活性最主要网络化在肿癌体安排性中,hdWGCNA分享区分出9个染色体输出模块(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的繁衍分享肯定YBX1为独立性繁衍隐患客观因素(图1H)。进步骤切合IHC、WB研究和肿癌安排性与最靠近非肿癌安排性的房间转录组学数据资料显示集得知YBX1是肝体安排性癌治疗方法的暗藏靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被断定为控制HCC体细胞糖酵解的重中之重要素
02、YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物热量基础代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1利于HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1搭配并力促YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1融合并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化使得其磷碱化,才能使得其核转位
进一部查测YBX1的O-GlcNAc糖基化能否决定其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC生殖组织中或用OGT阻止剂OSMI-1处里,YBX1蛋清的的水平面不错大大少,YBX1磷酸性反应不错少(图4A-C)。IP检测表现,在一样的的Flag-YBX1底物的的水平面下,YBX1-WT的磷酸性反应的的水平面不错过于YBX1-T57A,是正因为磷酸性反应的多往往仅是正因为更高些的YBX1蛋清描述(图4D)。离心分离了核和质混合物发掘TMG处里的HCC生殖组织中YBX1核描述的变高(图4E-F),进一部发掘YBX1磷酸性反应的关键性调节器指数公式是AKT(图4G-I)。以下发掘突出O-GlcNAc糖基化可以通过带动其磷酸性反应来明显增强YBX1蛋清稳界定高性并带动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 呈现有好处于其进三步情况磷酸性反应呈现并可能促进会其核转位
05、YBX1加快PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1可以淡化PKM2转录
06、YBX1 可从而提高组蛋白酶乳过酸体现的水平
科研遇到YBX1敲低同质性较低淀粉酶酶质乳过酸,更是要格外重视是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解压药物制剂2-DG的工作可确认了糖酵解与组淀粉酶酶乳过酸的单独连接,压制糖酵解可同质性较低H3K18la情况(图6D)。PKM2过表达方式出可逆性转YBX1敲低造成的的H3K18la的降低,以外源乳酸处理仅仅优化H3K18la,还随着YBX1表达方式出调整,建议有着正面评价(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR可确认,H3K18la在丰度于YBX1发动子单独可以淡化其转录,该过程中 受O-GlcNAc糖基化调节管控(图6H-J),并遇到P300 调整是YBX1激发H3K18乳酰化做用的长效机制(图6K-L)。
图6.YBX1减弱H3K18乳硝化作用修饰语品质
优秀文章工作小结
在一项探讨中曝光了YBX1在HCC中高描述,还与糖酵解秘切重要性。YBX1在T57处被O-GlcNAc绘制,而使平稳蛋清质并不断增加其描述。该种绘制还力促YBX1在T57处的磷碱化,力促其核易位。故此,该操作过程激发了糖酵解重要性dna遗传的转录并促使乳酸的所产生。除此之外,YBX1激活卡P300的转录,于是驱动程序组蛋清的乳碱化,专门是H3K18la,H3K18乳碱化领域管控YBX1dna遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传的正反面馈环长效机制图
拜谱个人总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生态学为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向治疗热量新陈代谢组技术服务,拜谱动物建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、泰语翻译后体现组学、基础代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参阅论文论文参考文献
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.