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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 系统药学学呈现草酸钙肾结石腐蚀应激性和支原体感染问题体制

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿程序最易见的症状组成。肾机构中CaOx单晶体过达到饱和状态累积会引起肾小管内部伤到和凋亡,才能引起肾结石的导致。短链肌肉酸由胃肠腔内水解酸化池疾病进行发酵营养饮食弹性纤维带来,不仅能在边缘胃肠腔第一道防线中表现使用,然而在程序能力上也表现至关重要使用。中仅,丁酸是最多样化的短链肌肉酸,兼有免役可抑制和免役可抑制使用,本设计浅析丁酸对CaOx肾结石的使用试述不确定性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山大医院泌尿普外吴忠教受、周子健博士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲解、周子健医学博士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了系统临床药理学安全服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

本文英文名称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 业主计量单位:华山宠物医院 理论研究文本:大鼠、HK-2神经元 分类数据:對照组(Con)、模式化组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱给予技术工艺:电脑网络临床药理学检侧

一个构想工艺流程

研究方案最终

论述师先要在校园营销推广活动的环节之中所构建大鼠型号,在生理变化什么是生化指标体系和进行方面的问题学印染等论述行为感觉丁酸行才能减少CaOx型号大鼠肾CaOx氯化钠晶体的型成和直接伤害,优化CaOx型号大鼠的宫颈炎症直接伤害和氧化物反应类物质的频繁表达方法。另外,丁酸还可限制草酸诱导型的HK-2細胞直接伤害、氧化物反应应激性和細胞凋亡。 为探求丁酸组成和靶染色体动态数据信息分享数据互联网上,设计员工从PubChem调用丁酸和丁酸酯的二维和三维图像组成(图1A)。凭借PharmMapper动态数据信息分享库和Uniprot动态数据信息分享库外理后共需求出116个丁酸靶染色体供进一个步骤分享。将染色体列表框导入到STRING动态数据信息分享库,实现PPI动态数据信息分享数据互联网上分享。Cytoscape已给出了筛选的前20的联络线靶染色体的详解动态数据信息分享数据互联网上图,最包括的包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。等等联络线染色体与动态数据信息分享数据互联网上中的别染色体均展示出必然的各种相关内容定性分析,意味着等等染色体或许产生着协作影响。GO和KEGG分享折射出了丁酸联络线染色体的各种相关内容路经和生物制品制品学模块(图1C)。联络线染色体最包括的与类固醇生长肾上腺素初次回话、阳极氧化化学反应应激性性初次回话、生物制品学活化氧细胞系对类固醇生长肾上腺素畅快的不起能力或对弱酸性生物制品学物料的不起能力光于。以上所讲,等等联络线染色体最包括的陆续参与了阳极氧化化学反应应激性性和对生物制品学活化氧的生物制品制品不起能力过程中,是肾结石进行体制中至关最核心的路经,这意味着丁酸或许在肾结石中产生最核心影响。

图1| 丁酸成分与靶DNA系统深入分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一个步骤深入学习丁酸对CaOx肾结石或许切靶什么是dna,学习成员再生利用GEO动态数据表格库对GSE73680中身体比与CaOx肾结石爱美者的什么是dna互相影响力来做好了学习。比组与CaOx结石爱美者的相应的系数性互相影响力描述什么是dna(DEGs)筛分原则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个什么是dna的发生相应的系数发生改变,在这其中3379个(89.4%)什么是dna描述调涨,404个(10.6%)什么是dna描述下跌(图2A)。对DEGs来做好聚类分析浅析浅析,热图提示 了前10个被选中DEGs的二维上下分层聚类分析浅析的特点(图2B)。接着,学习成员采用GeneCards动态数据表格库人工客服监定了370个概率与CaOx肾结石相应的的什么是dna,名列前20位的分折什么是dna十分相应的性评级如图是2C如图。要为找自己丁酸治療CaOx肾结石的根本靶点,学习成员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应的什么是dna整理能够 了个Venn图。进而,CYP2C9被知道为丁酸影响力CaOx肾结石的风险靶点(图2D)。另外,学习成员还来做好了丁酸与CYP2C9的原子接入,CYP2C9的八个有机酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互相使用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在再生利用网咯临床药理学預測CYP2C9是丁酸的影响CaOx肾结石的靶染色体后,研究方案相关人员还顺利通过細胞实验报告印证了CYP2C9可较低草酸诱发的HK-2細胞的ROS关卡、宫颈炎症伤害和凋亡。

图2| 大多据库携手阐述预测分析CYP2C9是丁酸的功效于CaOx肾结石的靶基因遗传

探析成果

本设计一开始感觉丁酸在休内和休内均能阻止CaOx肾结石模式化的空气被氧化应激反应反应和慢性发炎病变伤害,接着随后确认电脑微信网络药剂学学挑选取到丁酸干扰CaOx肾结石的隐性靶点——CYP2C9,然后确认上皮细胞膜检测印证CYP2C9在草酸盐引导的HK-2上皮细胞膜ROS的水平、慢性发炎病变伤害和凋亡。这种感觉显示丁酸已经确认阻止CYP2C9来阻止CaOx肾结石的空气被氧化应激反应反应,缓解慢性发炎病变伤害。这类进程中拜谱菌物出具了电脑微信网络药剂学学技能性售后安全服务,最后拜谱菌物可提生比较成熟建立完善的人类基因组学、营养素质组学、分解代谢组学等多个学车辆及技能性售后安全服务,的欢迎致电的方式详询! 参阅论文:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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