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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抵抗能力外来物种特女性朋友、寡核苷酸遮盖成本预算高涨或运作的流程僵化。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯硕士生导师精英团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低直接费用、跨动物群、全系统兼容的全新解决方案。

论文期刊简单介绍

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我们学科技术院基因隔代遗传性性与发肓微生物制品探究所和我们基因隔代遗传性性学到承办的国际级学界论文刊物,强院于有关报道健康学科技术和医学界基因隔代遗传性性学方向的我们独创性探究效果。JGG 2025年度后果细胞7.1,Scopus学界论文刊物如何评价依据CiteScore 9.9,排名第JCR 2025年度GENETICS & HEREDITY方向Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY方向Q1区,排名第我们学科技术院论文刊物划分微生物制品大类别1区(Top论文刊物),基因隔代遗传性性学和血生化与分子式微生物制品小类双1区。

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是那么到底怎样的才是HEATag

幽默的“二合为一体”设计制作

HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成的就结合球蛋白

「定位手机器」控制器 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化突显(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「接入器」功能 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)数据库索引长形码实施共价相连。

“1+1>2”的特效:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样例标识与追溯。

Fig1: HEATag多种标记符号机制展示图

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进阶篇产品检验

HEATag究竟有可以打?

也可以在不同于状况下,构建辅乳期节肢动物肿瘤神经元系单肿瘤神经元混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。论述专业团体为 HEATag 设立了多轮 “的压测英文”,从内部系到内部核,从室温到较低温度,从新鲜样版到确定样版,全定位效验它的准确性和准确性。

1、轮检验对蒲乳期动物界血组织系:研究方案相关人员进行了位于人、鼠、仓鼠这几个外来种类的四大血组织(HEK293T、K562、MEF、CHO),在恒温下能 HEATag 标上后混杂测序。不可能收购的 11447 个血组织中,85.66% 都能实现 HEATag 方形码较准配备到原外来种类,样品间相互水污染较少,UMAP 聚类具体分析具体分析更加是同时发现,HEATag 方形码与外来种类特喜欢的人人类基因组特证超高不一。 又,考试因素进一歩更新:学习相应的人员品尝在 4℃下产品标签生鲜人体受损内部、在环境温度下产品标签甲醇规定人体受损内部,以至于进行产品标签人体受损内部核。的最后还吸睛:每个因素下,样例产品标签与鱼类信息均具备良好的相应的性,拆成精确率超 95%。尽管甲醇规定会引发轻的转录本对称感染,人体受损内部核光催化原理也会有少许 RNA 匮乏,人体受损内部多种类型的注音的最后还与生鲜样例始终维持完全一致,证明书 HEATag 行产品标签各不相同治疗因素下的测试样例。

Fig2: HEATag 可在各种條件下完成任务单细胞核转录组混样阐述

还可以标记符号哺乳期间動物和浮游生物无脊椎神经動物的原代神经元

这样说血血细胞系測試是 “理论知识题”,那集体子模板也就是 “额外添加题”, 这样子模板之所以因血血细胞性质更复杂、室内环境改变性层次性,称为标志工艺的 “存在的问题”,而 HEATag 正好在这样 “存在的问题” 上能够 了特点。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸团队,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不仅能能被最准确判别,很多常见细胞膜款式的聚类分析法结论都不清可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海域菌物的适用性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 条型码与动物群转录组更具较高统一性,无经常出现因高盐自然环境导至的 “标识已过期”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可达成乳期昆虫聚集样品多沉 scRNA-seq 具体分析

Fig4: HEATag可进行新鲜的海洋环境无脊梁骨节肢动物多种 scRNA-seq 定性分析

HEATag与组织细胞的紧密联系没诱发转录组的可观变换

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在来完成标识工作的还,都不会对下一步的转录类物质析产生要素,维持了的研究统计数据的最可靠性。

Fig5: HEATag不是影响力子样本的 RNA 描述方法

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中国青春正当时

HEATag 能为单神经元分析带来了有什么?

HEATag 的商业价值,远不绝于 “满足标上方面”,它的便捷性和共通性,稍后为单细胞膜深入分析开启较多很有可能

从使用游戏场景看来

HEATag 能盖住从 “非常简单比论述分析”(如癌公司与平常公司、药物治疗治疗与较)到 “大产值论述”(如公司组织细胞核图谱制图、mtk量选择)的全范畴消费需求。发生变化 PIP-seq、Stereo-cell 等新式的可初始化新技术的快速发展,HEATag 还能进一次加快单组织细胞核论述的通量,推助研发团队协作抓好更具产值的该项目。

从跨方向竞争力来看看

HEATag 一方面适用到于转录组学,还能与表观基因组组学、蛋清质组学、区域空间组学等新新技术容入,凭借自定义引索和寡核苷酸字段,HEATag 会愉快容入各种的组学流程步骤,不的影响走势捕捉到广度。一并,鉴于HEATag还会趋势单上皮细胞糖组学论述新新技术。

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合作项目新动态

拜谱海洋生物与陈凯教受已达成逐项合伙有意向的

最该注意的是,在 HEATag 技艺能够出巨型使用软件价值的的背景下,拜谱浅海菌物已与南方地区浅海数学与过程惠州市科学试验室(长沙 )陈凯院士达到目标开始警税购房意向。另一方筹划包围 HEATag 技艺的工业化洛地、教学研发有效的转化等角度进行的深度警税,着力推进哪一低料工费、跨种群的单上皮组织细胞核图标技艺快速使用软件于实际效果教学研发应用场景,为一些科学试验室作为极有效率、国家经济的单上皮组织细胞核探析交通工具,助推器教学研发业务者在上皮组织细胞核浅海菌物学、浅海浅海菌物学、急病机能等域授予一些提升
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